Контигтер тіректерге қалай жиналады?
Контигтер тіректерге қалай жиналады?

Бейне: Контигтер тіректерге қалай жиналады?

Бейне: Контигтер тіректерге қалай жиналады?
Бейне: 💡Қарапайым, тиімді және үнемдеусіз: Honda-дан (C35A5) V6 моделін бөлшектеңіз. Субтитрлер! 2024, Қараша
Anonim

Геном жобасын жасау кезінде ДНҚ-ның жеке оқулары бірінші орында контигтерге жиналады , олардың табиғаты бойынша құрастыру , олардың арасында бос орындар бар. Келесі қадам дейін содан кейін олардың арасындағы алшақтықты толтырыңыз дейін жалғасады жасау а тірек . Мұны оптикалық салыстыру немесе жұптық реттілік арқылы жасауға болады.

Сол сияқты, сіз контигтер мен тіректер дегеніміз не?

А тірек соңғы реттелген тұтас геномды шолақ мылтық клондарынан қалпына келтірілген геном тізбегінің бөлігі болып табылады. Орандар тұрады контигтер және бос орындар. А контиг - негіздердің реті жоғары сенімділік деңгейіне дейін белгілі болатын геномдық тізбектің сабақтас ұзындығы. Кейбір жағдайларда, тіректер қабаттасуы мүмкін.

Сондай-ақ, биоинформатикадағы контиг дегеніміз не? А контиг (іргелестен) - ДНҚ-ның консенсус аймағын білдіретін қабаттасатын ДНҚ сегменттерінің жиынтығы. Контигтер осылайша, контекстке байланысты бір-біріне сәйкес келетін ДНҚ тізбегіне де, клондардағы қабаттасатын физикалық сегменттерге де (фрагменттерге) сілтеме жасай алады.

Осыған байланысты контигтер қалай құрастырылады?

ДНҚ фрагменттерінің қабаттасатын ДНҚ тізбегінің жиынтығы a ретінде белгілі контиг . Контиг картаға түсіру - қабаттасатын клондар болатын процесс жиналған осы қабаттасуды реттілікке келтіру үшін. Бұл ұйымдастыруды қамтиды контигтер реті мен бағдары бойынша. Клондау контигтер автоматты түрде болуы мүмкін жиналған олардың BAC-соңындағы тізбектерін пайдалану.

Неліктен контигтер маңызды?

Контиг құрастыру болып табылады маңызды геномды құрастыру сатысы. Карталау үшін қабаттасатын клондар бір-біріне сәйкес келетін реттілікке жиналады. Әрбір фрагмент векторда клондалады және шамамен 600–700 бит реттілік ұзындығын алу үшін екі ұшынан реттелген. ДНҚ фрагментінің екі ұшынан келетін тізбек жұп ұш деп аталады.

Ұсынылған: